家庭診療/感染是如何發生的
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多數感染性疾病是由侵入機體並進行繁殖的微生物所引起。而多數微生物的入侵又是當它們粘附於人體細胞開始的。粘附是一個非常特別的過程，包括了人體細胞和微生物間的密切連接（見免疫系統生物學）。是否微生物留在侵入原位附近或擴散至遠處取決於它們是否產生毒素、酶或其他物質等因素。
某些侵入機體的微生物產生對其附近或遠距離的機體細胞有毒的毒素，多數毒素成分特異性連接到特定細胞（靶細胞）上的某些分子上，並由此引起疾病。由這種毒素起主導作用所致的疾病包括破傷風、中毒性休克症候群和霍亂。少數感染性疾病是由微生物在體外產生的毒素所引起，由葡萄球菌引起的食物中毒就是一個很好的例子。
微生物入侵以後必須要繁殖才引起感染。然後可能出現下述三種情況之一。首先，微生物能繼續繁殖並能克服機體的防禦系統，這個過程能引起足夠的損害甚至導致死亡；其次，能達到一種平衡狀態，引起一種慢性感染，在這種爭鬥中，無論微生物或者病人均未獲勝。最後，機體不管有或無藥物治療，能消除入侵的微生物。這時機體可重建健康並常能提供對相同微生物引起的另一次感染的持久免疫狀態。
很多致病微生物具有增加疾病的嚴重性（毒力）和耐受機體防禦機制的特點。例如某些細菌產生破壞組織的酶，使感染擴散得更快。
某些微生物具有阻斷人體防禦機制的方法，如某些微生物能干擾機體抗體的產生或能特異性地攻擊它們的一種白細胞——T細胞的發展。另一些微生物具有外殼（包囊）能耐受白細胞的消化。隱球菌在侵入肺部後可形成一種較厚的囊膜，其發生的理由為這種較厚的囊膜形成是在二氧化碳環境下，而肺內較之真菌正常生長的土壤中有更多CO2，這樣，當肺部受隱球菌感染時，機體防禦機制就沒法起到作用。某些細菌能耐受血流循環中某些物質的分解（溶解），某些微生物甚至能產生對抗抗生素作用的化學物質。
 常住菌群 | 感染對機體的影響  |
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