生物化學與分子生物學/糖的有氧氧化
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葡萄糖在有氧條件下，氧化分解生成二氧化碳和水的過程稱為糖的有氧氧化(aerobicoxidation)。有氧氧化是糖分解代謝的主要方式，大多數組織中的葡萄糖均進行有氧氧化分解供給機體能量。
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(一)有氧氧化過程
糖的有氧氧化分兩個階段進行。第一階段是由葡萄糖生成的丙酮酸，在細胞液中進行。第二階段是上述過程中產生的NADH+H+和丙酮酸在有氧狀態下，進入粒線體中，丙酮酸氧化脫羧生成乙醯CoA進入三羧酸循環，進而氧化生成CO2和H2O，同時NADH+H+等可經呼吸鏈傳遞，伴隨氧化磷酸化過程生成H2O和ATP，下面主要將討論有氧氧化在粒線體中進行的第二階段代謝。
1.丙酮酸的氧化脫羧
催化氧化脫羧的酶是丙酮酸脫氫酶系(pyruvatedehydrogenase system)，此多酶複合體括丙酮酸脫羧酶，輔酶是TPP，二氫硫辛酸乙醯轉移酶，輔酶是二氫硫辛酸和輔酶A，還有二氫硫辛酸脫氫酶，輔酶是FAD及存在於粒線體基質液中的NAD+，多酶複合體形成了緊密相連的連鎖反應機構，提高了催化效率。
從丙酮酸到乙醯CoA是糖有氧氧化中關鍵的不可逆反應，催化這個反應的丙酮酸脫氫酶系受到很多因素的影響，反應中的產物，乙醯CoA和NADH++H+可以分別抑制酶系中的二氫硫辛酸乙醯轉移酶和二氫硫辛酸脫氫酶的活性，丙酮酸脫羧酶(pyruvate decarboxylase,PDC)活性受ADP和胰島素的激活，受ATP的抑制。
丙酮酸脫氫反應的重要特徵是丙酮酸氧化釋放的自由能貯存在乙醯CoA中的高能硫酯鍵中，並生成NADH+H+(圖4-4)。
圖4-4 丙酮酸脫氫酶複合物的作用機制
2.三羧酸循環(tricarboxylic acid cycle)
乙醯CoA進入由一連串反應構成的循環體系，被氧化生成H2O和CO2。由於這個循環反應開始於乙醯CoA與草醯乙酸(oxaloacetate)縮合生成的含有三個羧基的檸檬酸，因此稱之為三羧酸循環或檸檬酸循環(citric acid cycle)。其詳細過程如下：
(1)乙醯CoA進入三羧酸循環
乙醯CoA具有硫酯鍵，乙醯基有足夠能量與草醯乙酸的羧基進行醛醇型縮合。首先從CH3CO基上除去一個H+，生成的陰離子對草醯乙酸的羰基碳進行親核攻擊，生成檸檬醯CoA中間體，然後高能硫酯鍵水解放出遊離的檸檬酸，使反應不可逆地向右進行。該反應由檸檬酸合成酶(citrate synthetase)催化，是很強的放能反應。
由草醯乙酸和乙醯CoA合成檸檬酸是三羧酸循環的重要調節點，檸檬酸合成酶是一個變構酶，ATP是檸檬酸合成酶的變構抑制劑，此外，α-酮戊二酸、NADH能變構抑制其活性，長鏈脂醯CoA也可抑制它的活性，AMP可對抗ATP的抑制而起激活作用。
(2)異檸檬酸形成
檸檬酸的叔醇基不易氧化，轉變成異檸檬酸而使叔醇變成仲醇，就易於氧化，此反應由順烏頭酸酶催化，為一可逆反應。
(3)第一次氧化脫酸
在異檸檬酸脫氫酶作用下，異檸檬酸的仲醇氧化成羰基，生成草醯琥珀酸(oxalosuccinate)的中間產物，後者在同一酶表面，快速脫羧生成α-酮戊二酸(αketoglutarate)、NADH和CO2，此反應為β-氧化脫羧，此酶需要Mn2+作為激活劑。
此反應是不可逆的，是三羧酸循環中的限速步驟，ADP是異檸檬酸脫氫酶的激活劑，而ATP，NADH是此酶的抑制劑。
(4)第二次氧化脫羧
在α-酮戊二酸脫氫酶系作用下，α-酮戊二酸氧化脫羧生成琥珀醯CoA、NADH+H+和CO2，反應過程完全類似於丙酮酸脫氫酶系催化的氧化脫羧，屬於α氧化脫羧，氧化產生的能量中一部分儲存於琥珀醯CoA的高能硫酯鍵中。
α-酮戊二酸脫氫酶系也由三個酶(α-酮戊二酸脫羧酶、硫辛酸琥珀醯基轉移酶、二氫硫辛酸脫氫酶)和五個輔酶(TPP、硫辛酸、HSCoA、NAD+、FAD)組成。
此反應也是不可逆的。α-酮戊二酸脫氫酶複合體受ATP、GTP、NAPH和琥珀醯CoA抑制，但其不受磷酸化/去磷酸化的調控。
在琥珀酸硫激酶(succinatethiokinase)的作用下，琥珀醯CoA的硫酯鍵水解，釋放的自由能用於合成GTP，在細菌和高等生物可直接生成ATP，在哺乳動物中，先生成GTP，再生成ATP，此時，琥珀醯CoA生成琥珀酸和輔酶A。
(6)琥珀酸脫氫
琥珀酸脫氫酶(succinatedehydrogenase)催化琥珀酸氧化成為延胡索酸。該酶結合在粒線體內膜上，而其他三羧酸循環的酶則都是存在粒線體基質中的，這酶含有鐵硫中心和共價結合的FAD，來自琥珀酸的電子通過FAD和鐵硫中心，然後進入電子傳遞鏈到O2，丙二酸是琥珀酸的類似物，是琥珀酸脫氫酶強有力的競爭性抑制物，所以可以阻斷三羧酸循環。
(7)延胡索酸的水化
延胡索酸酶僅對延胡索酸的反式雙鍵起作用，而對順丁烯二酸(馬來酸)則無催化作用，因而是高度立體特異性的。
(8)草醯乙酸再生
在蘋果酸脫氫酶(malicdehydrogenase)作用下，蘋果酸仲醇基脫氫氧化成羰基，生成草醯乙酸(oxalocetate)，NAD+是脫氫酶的輔酶，接受氫成為NADH+H+(圖4-5)。
圖4-5 三羧酸循環
三羰酸循環總結：
乙醯CoA+3NADH++FAD+GDP+Pi+2H2O—→
2CO2+3NADH+FADH2+GTP+3H+ +CoASH
①CO2的生成，循環中有兩次脫羧基反應(反應3和反應4)兩次都同時有脫氫作用，但作用的機理不同，由異檸檬酸脫氫酶所催化的β氧化脫羧，輔酶是NAD+，它們先使底物脫氫生成草醯琥珀酸，然後在Mn2+或Mg2+的協同下，脫去羧基，生成α-酮戊二酸。
α-酮戊二酸脫氫酶系所催化的α氧化脫羧反應和前述丙酮酸脫氫酶系所催經的反應基本相同。
應當指出，通過脫羧作用生成CO2，是機體內產生CO2的普遍規律，由此可見，機體CO2的生成與體外燃燒生成CO2的過程截然不同。
②三羧酸循環的四次脫氫，其中三對氫原子以NAD+為受氫體，一對以FAD為受氫體，分別還原生成NADH+H+和FADH2。它們又經粒線體內遞氫體系傳遞，最終與氧結合生成水，在此過程中釋放出來的能量使ADP和Pi結合生成ATP，凡NADH+H+參與的遞氫體系，每2H氧化成一分子H2O，生成3分子ATP，而FADH2參與的遞氫體系則生成2分子ATP，再加上三羧酸循環中有一次底物磷酸化產生一分子ATP，那麼，一分子CH2COSCoA參與三羧酸循環，直至循環終末共生成12分子ATP。
③乙醯CoA中乙醯基的碳原子，乙醯CoA進入循環，與四碳受體分子草醯乙酸縮合，生成六碳的檸檬酸，在三羧酸循環中有二次脫羧生成2分子CO2，與進入循環的二碳乙醯基的碳原子數相等，但是，以CO2方式失去的碳並非來自乙醯基的兩個碳原子，而是來自草醯乙酸。
④三羧酸循環的中間產物，從理論上講，可以循環不消耗，但是由於循環中的某些組成成分還可參與合成其他物質，而其他物質也可不斷通過多種途徑而生成中間產物，所以說三羧酸循環組成成分處於不斷更新之中。
α-酮戊二酸——→谷氨酸
草醯乙酸——→丙酮酸——→丙氨酸
其中丙酮酸羧化酶催化的生成草醯乙酸的反應最為重要。
因為草醯乙酸的含量多少，直接影響循環的速度，因此不斷補充草醯乙酸是使三羧酸循環得以順利進行的關鍵。
三羧酸循環中生成的蘋果酸和草醯乙酸也可以脫羧生成丙酮酸，再參與合成許多其他物質或進一步氧化(圖4-6)。
(二)糖有氧氧化的生理意義
1.三羧酸循環是機體獲取能量的主要方式。1個分子葡萄糖經無氧酵解僅淨生成2個分子ATP，而有氧氧化可淨生成38個ATP(如表4?)，其中三羧酸循環生成24個ATP，在一般生理條件下，許多組織細胞皆從糖的有氧氧化獲得能量。糖的有氧氧化不但釋能效率高，而且逐步釋能，並逐步儲存於ATP分子中，因此能的利用率也很高。
2.三羧酸循環是糖，脂肪和蛋白質三種主要有機物在體內徹底氧化的共同代謝途徑，三羧酸循環的起始物乙醯輔酶A，不但是糖氧化分解產物，它也可來自脂肪的甘油、脂肪酸和來自蛋白質的某些胺基酸代謝，因此三羧酸循環實際上是三種主要有機物在體內氧化供能的共同通路，估計人體內2/3的有機物是通過三羧酸循環而被分解的。
3.三羧酸循環是體內三種主要有機物互變的聯結機構，因糖和甘油在體內代謝可生成α-酮戊二酸及草醯乙酸等三羧酸循環的中間產物，這些中間產物可以轉變成為某些胺基酸；而有些胺基酸又可通過不同途徑變成α-酮戊二酸和草醯乙酸，再經糖異生的途徑生成糖或轉變成甘油，因此三羧酸循環不僅是三種主要的有機物分解代謝的最終共同途徑，而且也是它們互變的聯絡機構。
(三)糖有氧氧化的調節
如上所述糖有氧氧化分為兩個階段，第一階段糖酵解途徑的調節在糖酵解部分已探討過，下面主要討論第二階段丙酸酸氧化脫羧生成乙醯CoA並進入三羧酸循環的一系列反應的調節。丙酮酸脫氫酶複合體、檸檬酸合成酶、異檸檬酸脫氫酶和α-酮戊二酸脫氫酶複合體是這一過程的限速酶。
丙酮酸脫氫酶複合體受別位調控也受化學修飾調控，該酶複合體受它的催化產物ATP、乙醯CoA和NADH有力的抑制，這種別位抑制可被長鏈脂肪酸所增強，當進入三羧酸循環的乙醯CoA減少，而AMP、輔酶A和NAD+堆積，酶複合體就被別位激活，除上述別位調節，在脊椎動物還有第二層次的調節，即酶蛋白的化學修飾，PDH含有兩個亞基，其中一個亞基上特定的一個絲氨酸殘基經磷酸化後，酶活性就受抑制，脫磷酸化活性就恢復，磷酸化-脫磷酸化作用是由特異的磷酸激酶和磷酸蛋白磷酸酶分別催化的，它們實際上也是丙酮酸酶複合體的組成，即前已述及的調節蛋白，激酶受ATP別位激活，當ATP高時，PDH就磷酸化而被激活，當ATP濃度下降，激酶活性也降低，而磷酸酶除去PDH上磷酸，PDH又被激活了。
對三羧酸循環中檸檬酸合成酶、異檸檬酸脫氫酶和α-酮戊二酸脫氫酶的調節，主要通過產物的反饋抑制來實現的，而三羧酸循環是機體產能的主要方式。因此ATP/ADP與NADH/NAD+兩者的比值是其主要調節物。ATP/ADP比值升高，抑制檸檬酸合成酶和異檸檬酶脫氫酶活性，反之ATP/ADP比值下降可激活上述兩個酶。NADH/NAD+比值升高抑制檸檬酸合成酶和α-酮戊二酸脫氫酶活性，除上述ATP/ADP與NADH/NAD+之外其它一些代謝產物對酶的活性也有影響，如檸檬酸抑制檸檬酸合成酶活性，而琥珀醯CoA抑制α-酮戊二酸脫氫酶活性。總之，組織中代謝產物決定循環反應的速度，以便調節機體ATP和NADH濃度，保證機體能量供給。(圖4-7)。
圖4-6 三羧酸循環中還原型輔酶和CO2的生成
圖4-7 三羧酸循環的抑制劑和激活劑
(四)有氧氧化和糖酵解的相互調節
Pasteur在研究酵母發酵時，發現在供氧充足的條件下，細胞內糖酵解作用受到抑制。葡萄糖消耗和乳酸生成減少，這種有氧氧化對糖酵解的抑制作用稱為巴士德效應(Pasteureffect)。
產生巴士德效應主要是由於在供氧充足的條件下，細胞內ATP/ADP比值升高，抑制了PK和PFK，使6-磷酸果糖和6-磷酸葡萄糖含量增加，後者反饋抑制已糖激權衡利弊（HK），使葡萄糖利用減少，呈現有氧氧化對糖酵解的抑制作用。
Crabtree效應與巴士德效應相反，在癌細胞發現給予葡萄糖時不論供氧充足與否都呈現很強的酵解反應，而糖的有氧氧化受抑制，稱為Crabtree效應或反巴士德效應。這種現象較普遍地存在於癌細胞中，此外也存在於一些正常組織細胞如視網膜、睾丸、顆粒白細胞等。
一般認為，具Crabtree效應的細胞，其酵解酶系(如PK、PFK、HK+)活性強，而粒線體內氧化酶系如細胞色素氧化酶活性則較低，它們在爭奪ADF、Pi及ADH+H+方面粒線體必然處於劣勢，因而缺乏進行氧化磷酸化的底物，即使在供氧充足的情況下，其有氧氧化生成ATP的能力仍低於正常細胞，呈現Crabtree效應。
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