播散性淋球菌感染是由於淋球菌通過血行播散到全身，出現較嚴重的全身感染。發病率為淋病患者的1%左右。引起播散性淋菌感染的菌株多為AHU-營養型，該菌株對正常人血清具有穩定的抵抗力，另外正常人血清中有對淋球菌脂多糖的IgM抗體，在補體的協助下，對大多數淋菌是有殺菌作用，缺乏C5、C6、C7和C8等補體成份的病人很容易患淋菌性敗血症或淋菌性腦膜炎。
（一）淋菌性敗血症：患者開始發熱，體溫可高達40℃，但通常是在38℃-40℃之間，寒戰卻不常見，有部分病人發生皮膚丘疹，瘀斑，膿皰性、出血性或壞死性皮膚損害，部分皮損處有疼痛症状。在皮損處，用熒光免疫染色可查到淋球菌或培養有淋球菌生長，PCR檢測淋球菌DNA陽性。皮損的病理組織表現為淺表性潰瘍並有膿液形成，真皮及皮下組織瀰漫性炎症，有多形核白細胞浸潤，並累及小血管，有血栓形成和局限性的壞死。
（二）淋菌性關節炎：關節腫脹、疼痛，為一個或數個化膿性關節炎。一般不對稱，很少累及髖、肩和脊柱關節。關節液化驗有淋病雙球菌存在，可導致骨質破壞引起纖維化，骨關節強直。
（三）淋菌性角化症：可能是由於淋球菌或其毒素所致，皮損中找不到淋球菌，常與淋菌性關節炎並發，皮損好發部位為手足、踝跟部和腰部。通常為扁平角化性稍隆起的斑片或斑塊，呈圓錐形，黃色，或銅紅色或灰白色。掌跖的皮損呈角質增生，大片角化。
（四）淋菌性心內膜炎：抗生素使用前幾十年中，淋球菌是心內膜炎的主要病原體，目前淋菌性心內膜炎幾乎見不到，淋菌性心內膜炎和其他類型心內膜炎有相同的臨床表現。心內膜炎時，常累及主動脈瓣或二尖瓣，因瓣膜的快速破壞所致的亞急性或急性心內膜炎，而導致死亡。
（五）淋菌性腦膜炎：不常見，可伴有關節炎和典型皮疹，以區分腦膜炎球菌性腦膜炎。
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