生物化學與分子生物學/超二級結構和結構域

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生物化學與分子生物學

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圖1-7 蛋白質的超二級結構示意

a.αα組合 b.βββ組合 c.βαβ組合

超二級結構(supersecondarystructure)是指在多肽鏈內順序上相互鄰近的二級結構常常在空間摺疊中靠近,彼此相互作用,形成規則的二級結構聚集體。目前發現的超二級結構有三種基本形式:α螺旋組合(αα);β摺疊組合(βββ)和α螺旋β摺疊組合(βαβ)(圖1-7),其中以βαβ組合最為常見。它們可直接作為三級結構的「建築塊」或結構域的組成單位,是蛋白質構象中二級結構與三級結構之間的一個層次,故稱超二級結構。

結構域(domain)也是蛋白質構象中二級結構與三級結構之間的一個層次。在較大的蛋白質分子中,由於多肽鏈上相鄰的超二級結構緊密聯繫,形成二個或多個在空間上可以明顯區別它與蛋白質亞基結構的區別。一般每個結構域約由100-200個胺基酸殘基組成,各有獨特的空間構象,並承擔不同的生物學功能。如免疫球蛋白(IgG)由12個結構域組成,其中兩個輕鏈上各有2個,兩個重鏈上各有4個;補體結合部位與抗原結合部位處於不同的結構域。一個蛋白質分子中的幾個結構域有的相同,有的不同;而不同蛋白質分子之間肽鏈中的各結構域也可以相同。如乳酸脫氫酶、3-磷酸甘油醛脫氫酶蘋果脫氫酶等均屬以NAD+為輔酶的脫氫酶類,它們各自由2個不同的結構域組成,但它們與NAD+結合的結構域構象則基本相同。

 
32 蛋白質的二級結構 | 蛋白質的三級結構 32
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