生物化學與分子生物學/核酸的化學組成

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生物化學與分子生物學

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核酸是生物體內的高分子化合物,包括DNARNA兩大類。

一、元素組成

組成核酸的元素有C、H、O、N、P等,與蛋白質比較,其組成上有兩個特點:一是核酸一般不含元素S,二是核酸中P元素的含量較多並且恆定,約佔9~10%。因此,核酸定量測定的經典方法,是以測定P含量來代表核酸量。

二、化學組成與基本單位

核酸經水解可得到很多核苷酸,因此核苷酸是核酸的基本單位。核酸就是由很多單核苷酸聚合形成的多聚核苷酸。核苷酸可被水解產生核苷磷酸,核苷還可再進一步水解,產生戊糖含氮鹼基(圖15-1)。

核酸的組成


圖15-1 核酸的組成

核苷酸中的鹼基均為含氮雜環化合物,它們分別屬於嘌呤衍生物嘧啶衍生物。核苷酸中的嘌呤鹼(purine)主要是鳥嘌呤(guanine,G)和腺嘌呤(adenine,A),嘧啶鹼(pyrimidine)主要是胞嘧啶(cytosine,C)、尿嘧啶(uracil,U)和胸腺嘧啶(thymine,T)。DNA和RNA都含有鳥嘌呤(G)、腺嘌呤(A)和胞嘧啶(C);胸腺嘧啶(T)一般而言只存在於DNA中,不存在於RNA中;而尿嘧啶(U)只存在於RNA中,不存在於DNA中。它們的化學結構請參見圖示。

Grac47fr.jpg


核酸中五種鹼基中的酮基和氨基,均位於鹼基環中氮原子的鄰位,可以發生酮式一烯醇式或氨基亞氨基之間的結構互變。這種互變異構基因突變生物的進化中具有重要作用。

Grac4dq0.jpg


有些核酸中還含有修飾鹼基(modifiedcomponent),(或稀有鹼基,unusual component),這些鹼基大多是在上述嘌呤或嘧啶鹼的不同部位甲基化(methylation)或進行其它的化學修飾而形成的衍生物。一般這些鹼基在核酸中的含量稀少,在各種類型核酸中的分布也不均一。DNA中的修飾鹼基主要見於噬菌體DNA,如5-甲基胞嘧啶(m5C),5-羥甲基胞嘧啶hm5C;RNA中以tRNA含修飾鹼基最多,如1-甲基腺嘌呤(m1A),2,2一二甲基鳥嘌呤(m22G)和5,6-二氫尿嘧啶(DHU)等。

Grac44nn.jpg


嘌呤和嘧啶環中含有共軛雙鍵,對260nm左右波長的紫外光有較強的吸收。鹼基的這一特性常被用來對鹼基、核苷、核苷酸和核酸進行定性和定量分析。

核酸中的戊糖有核糖(ribose)和脫氧核糖(deoxyribose)兩種,分別存在於核糖核苷酸和脫氧核糖核苷酸中。為了與鹼基標號相區別,通常將戊糖的C原子編號都加上「′」,如C1′表示糖的第一位碳原子。

戊糖與嘧啶或嘌呤鹼以糖苷鍵連接就稱為核苷,通常是戊糖的C1′與嘧啶鹼的N1或嘌呤鹼的N9相連接。

核苷中戊糖的羥基與磷酸以磷酸酯鍵連接而成為核苷酸。生物體內的核苷酸大多數是核糖或脫氧核糖的C5′上羥基被磷酸酯化,形成5′核苷酸。核苷酸在5′進一步磷酸化即生成二磷酸核苷和三磷酸核苷。以核糖腺苷酸為例,除AMP外,還有二磷酸腺苷(ADP,adenosine 5′-diphosphate)和三磷酸腺苷(ATP,adenosine 5′-triphosphate)兩種形式。核苷酸的二磷酸酯和三磷酸酯多為核苷酸有關代謝的中間產物或者酶活性和代謝的調節物質,以及作為核苷酸有關代謝的中間產物或者酶活性和代謝的調節物質,以及作為生理儲能和供能的重要形式。

核苷酸還有環化的形式。它們主要是3′,5′-環化腺苷酸(cAMP,adenosine 3′,5′-cyclicmonophosphate)和3′,5′-環化鳥苷酸(cGMP,guanosine 3′,5′-cyclic monophosphate),化學結構如下。環化核苷酸在細胞內代謝的調節和跨細胞膜信號中起著十分重要的作用。

Grac4ad0.jpg


表15-1 核苷酸及相應的核苷、鹼基名稱中英文對照表

核苷酸 核苷 鹼基
腺苷酸(AMP) 腺苷 腺嘌呤(A)
adenosine monophosphate adenosine adenine
脫氧腺苷酸(dAMP) 脫氧腺苷
deoxydenosine monophosphate deoxyadenosine
鳥苷酸(GMP) 鳥苷 鳥嘌呤(G)
guanosine monophosphate guanosine guanine
脫氧鳥苷酸(dGMP) 脫氧鳥苷
deoxyguanosine monophosphate deoxyguanosine
胞苷酸(CMP) 胞苷 胞嘧啶(C)
cytidine monophosphate cytidine cytosine
胞氧胞苷酸(dCMP) 脫氧胞苷
deoxycytidine monophosphate deoxycytidine
胸苷酸(TMP/dTMP) 胸苷 胸腺嘧啶(T)
thymidine monophate thymidine thymine
尿苷酸(UMP) 尿苷 尿嘧啶(U)
uridine monophosphate uridine uracil
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