古蟲界

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古蟲界
籃氏賈第鞭毛蟲，一種人體寄生蟲
科學分類
域： 真核生物域 Eukaryota 界： 古蟲界 (Cavalier-Smith) Simpson, 2003
門
眼蟲門 Euglenozoa 透色門 Percolozoa 槽蟲門 Loukozoa 後滴門 Metamonada Malawimonas

古蟲界（excavate或Excavata）是單細胞真核生物的一個大的界^[1][2]。古蟲界包含了許多自由生存或共生的原生生物，以及一些重要的人體寄生蟲。命名為「古蟲」，是因為在真核生物的系統發生樹處於底部位置，與細菌、古菌等外群關係較近，粒線體可能缺失或功能原始。

目錄 1 特性 2 分類 2.1 Discoba或JEH亞界 2.2 後滴門 2.3 單系起源 2.4 馬拉威單胞蟲 3 參見 4 參考文獻 5 外部連結 6 參考來源

特性

許多古蟲界的物種缺乏典型的粒線體，被稱作「無粒線體原生生物」（amitochondriate），雖然大多數可能包含了功能上類似於粒線體、形態有很大變化的細胞器。其它的古蟲界的生物有粒線體，粒線體嵴呈管狀、盤狀、薄片狀。大多數古蟲界物種有兩個、四個甚至更多的鞭毛^[3]，很多物種有顯著的腹部攝食溝（feeding groove）超微結構，內部由微管支撐。^[4]如果有系統發生的基因證據，其它缺乏這一特徵的物種也可以歸屬於古蟲界。

分類

古蟲界在門/綱的級別上分為六類。

總門	門/綱	有代表性的屬	描述
盤嵴亞界 Discoba或JEH	眼蟲門 Euglenozoa	眼蟲（Euglena）、錐蟲（Trypanosoma）	很多是重要的寄生蟲，很多含有色素體（葉綠體）
	透色門 Percolozoa或滲養門 Heterolobosea	耐格里原蟲（Naegleria）、集胞黏菌（Acrasis）	大多數的形態在鞭毛蟲與似變形蟲之間
	雅各巴蟲綱 Jakobea	雅各巴蟲（Jakoba）、異養鞭毛蟲（Reclinomonas）	自由生活，有的具鞭毛，有基因豐富的粒線體
後滴門 Metamonada或POD	綱 Preaxostyla	銳滴蟲 (Oxymonads)、三鞭毛蟲（Trimastix）	無粒線體，有鞭毛，或者自由生活（三鞭毛蟲）或者寄生於昆蟲的後腸（hindgut）
	多鞭毛蟲綱 Trichozoa或Fornicata	賈第蟲（Giardia）、Carpediemonas	無粒線體，大多數共生或寄生在動物體內。
	副基體綱 Parabasalia	毛滴蟲屬（Trichomonas）	無粒線體有鞭毛，一般共生在昆蟲腸內。某些是人體寄生蟲。

Discoba或JEH亞界

眼蟲門（Euglenozoa）與透色門（Percolozoa, Heterolobosea）是特別接近的親緣關係，都具有盤狀的粒線體嵴，因此被歸納為盤嵴總門（Discicristata）。2007年，一項研究表明盤嵴總門與Jakobida目具有基因親緣關係^[5] Jakobida目具有類似於其它原生生物的管狀粒線體嵴，因此與盤嵴總門合稱為Discoba亞界或三者首字母縮寫——JEH總界。^[2]

後滴門

後滴門（Metamonad）不尋常地缺少了典型的粒線體——代替粒線體，這些生物具有氫化酶體（hydrogenosome），紡錘剩體（mitosome）或其它未識別的細胞器。共同特點是都沒有粒線體。基因分析表明，這些生物的細胞核中有粒線體的基因標誌。這些生物都是寄生生活的，能夠從其它來源獲得ATP。源真核生物的一個例子是毛滴蟲（Trichomonas Vaginalis），是常見的尿路感染，通過性接觸傳播。

單系起源

古蟲界是否為單系群（monophyletic group），仍然缺乏基因證據。可能是幾個並行的進化分支。^[6]

某些古蟲界的物種被認為是非常原始的真核生物，位於進化樹的底部。這示意古蟲界可能是多系群，包含著其它原生生物的祖先。但這也可能是由於長枝吸引（long branch attraction），這已經在微孢子蟲（microsporidia）中有過前例。

馬拉威單胞蟲

除上述類群外馬拉威單胞蟲綱（Malawimonas）由於其分子系統學證據被認為可能是古蟲中的一種，但其在其中的系統位置待定。^[7]

參見

• 源真核生物界
• 真核生物
• 原生生物

參考文獻

1. ↑ Simpson, Ag; Inagaki, Y; Roger, Aj. Comprehensive multigene phylogenies of excavate protists reveal the evolutionary positions of "primitive" eukaryotes (Free full text). Molecular Biology and Evolution. Mar 2006, 23 (3): 615–25. doi:10.1093/molbev/msj068. PMID 16308337 
2. ↑ ^{2.0 2.1} Hampl V, Hug L, Leigh JW, et al. Phylogenomic analyses support the monophyly of Excavata and resolve relationships among eukaryotic "supergroups". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.. March 2009, 106 (10): 3859–64. doi:10.1073/pnas.0807880106. PMID 19237557. PMC 2656170. 
3. ↑ Simpson AG. Cytoskeletal organization, phylogenetic affinities and systematics in the contentious taxon Excavata (Eukaryota). Int. J. Syst. Evol. Microbiol.. November 2003, 53 (Pt 6): 1759–77. doi:10.1099/ijs.0.02578-0. PMID 14657103. 
4. ↑ Cavalier-Smith T. The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa. Int. J. Syst. Evol. Microbiol.. March 2002, 52 (Pt 2): 297–354. PMID 11931142. 
5. ↑ Naiara Rodríguez-Ezpeleta, Henner Brinkmann, Gertraud Burger, Andrew J. Roger, Michael W. Gray, Hervé Philippe, and B. Franz Lang. Toward Resolving the Eukaryotic Tree: The Phylogenetic Positions of Jakobids and Cercozoans. Curr. Biol.. August 2007, 17 (16): 1420–1425. doi:10.1016/j.cub.2007.07.036. PMID 17689961. 
6. ↑ Laura Wegener Parfrey, Erika Barbero, Elyse Lasser, Micah Dunthorn, Debashish Bhattacharya, David J Patterson, and Laura A Katz. [http//www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1713255/ Evaluating Support for the Current Classification of Eukaryotic Diversity]. PLoS Genet.. December 2006, 2 (12): e220. doi:10.1371/journal.pgen.0020220. PMID 17194223. PMC 1713255. 
7. ↑ Cavalier-Smith T. The excavate protozoan phyla Metamonada Grassé emend. (Anaeromonadea, Parabasalia, Carpediemonas, Eopharyngia) and Loukozoa emend. (Jakobea, Malawimonas): their evolutionary affinities and new higher taxa. Int. J. Syst. Evol. Microbiol.. November 2003, 53 (Pt 6): 1741–58. doi:10.1099/ijs.0.02548-0. PMID 14657102. 

外部連結

• Tree of Life Eukaryotes
• Tree of Life: Jakobida
• Tree of Life: Fornicata

真核生物 域 古菌 細菌 真核生物 (界 植物 Hacrobia Template:不等鞭毛類 Template:囊泡蟲類 Template:有孔蟲界 古蟲 Template:變形蟲界 動物 真菌) 雙鞭毛生物 AH/SAR AH 原始色素體生物("A"), 或廣義植物 綠色植物/狹義植物 紅藻門 灰胞藻 定鞭/隱藻生物("H"), 或非SAR超類群的囊泡藻 定鞭藻門 隱藻門 中陽蟲門 SAR 不等鞭毛/囊泡生物 不等鞭毛類("S") 淡色藻總門 雙環總門 偽真菌總門 囊泡蟲類("A") 纖毛蟲門 粘孢子總門 頂復門 雙鞭毛蟲門 有孔蟲界("R") 絲足蟲類 有孔蟲類 有孔蟲門 放射蟲門 古蟲界 盤嵴亞界 眼蟲門 雅各巴蟲綱 透色門 槽蟲門 後滴門 馬拉威單胞蟲綱 無根蟲門 無根單胞蟲目 Apusomonas Amastigomonas 彎單胞蟲目 Ancyromonas 半主蟲目 Hemimastix Spironema Stereonema 單鞭毛生物 變形蟲界 葉足亞門 錐足亞門 Phalansterium Breviata 後鞭毛生物 動物總界 DRIP類群 膚胞蟲目 膚魚孢霉目 蜷絲生物 蜷絲球蟲綱 快孢子蟲目 小球蟲目 領鞭毛蟲綱 領鞭毛蟲 Salpingoecidae Acanthoecidae 動物界或 「後生動物」 真後生動物 兩側對稱動物 刺胞動物門 櫛水母門 中生動物門 側生動物 扁盤動物門 多孔動物門 菌物總界 真菌界 雙核亞界 子囊菌門 擔子菌門 球囊菌門 接合菌門 芽枝霉門 壺菌門 新美鞭菌門 微孢子蟲門 核形蟲類 Nuclearia Micronuclearia Rabdiophrys Pinaciophora Pompholyxophrys Fonticula 未分類 兩葉蟲綱 Collodictyon triciliatum Diphylleia rotans

古蟲界 域 古菌 細菌 真核生物 (界 植物 Hacrobia Template:不等鞭毛類 Template:囊泡蟲類 Template:有孔蟲界 古蟲 Template:變形蟲界 動物 真菌) 盤嵴亞界 (JEH亞界) 盤嵴總門 眼蟲門 裸藻綱 眼蟲 動質體綱：錐體蟲目 錐蟲 利什曼原蟲 透色門 異葉足綱 Schizopyrenida: Vahlkampfiidae Naegleria Neovahlkampfia Paravahlkampfia Psalteriomonas Sawyeria Tetramitus/Paratetramitus Vahlkampfia Willaertia Gruberellidae Stachyamoeba Rosculus Acrasidae Acrasis Heteramoeba Learamoeba Monopylocystis Stygamoeba 透色綱 Percolomonas Stephanopogon 槽蟲門 Andaluciida Andalucia 雅各巴蟲綱 Jakobidae Jakoba Histionidae Reclinomonas Histiona M+M 後滴門 Trichozoa 副基體綱 Trichomonadida Trichomonas Dientamoeba Mixotricha Histomonas Hypermastigia Trichonympha Fornicata Eopharingia Diplomonadida: Hexamitinae Spironucleus Hexamita Giardiinae 賈第蟲 Octomitus Retortamonadida Chilomastix Retortamonas 其它 Carpediemonadida Carpediemonas Dysnectes Anaeromonadea Trimastix Oxymonadida Dinenympha Pyrsonympha Oxymonas 其它 馬拉威單胞蟲綱 Template:CEA navs

參考來源

• 維基百科-古蟲界

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