基序

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英文motif的縮寫。

也翻譯為「模序」,「模體」

DNA,蛋白質等生物大分子中的保守序列

例如,在反式作用因子的結構中,基序一般指構成任何一種特徵序列的基本結構,作為結構域中的亞單元,其功能是體現結構域的多種生物學作用。

反式作用因子的DNA結合結構域(DNA binding domain)中的幾種常見基序:

①螺旋/轉角/螺旋(Helix-turn-helix,HTH)基序

兩段螺旋被一短的轉角結構分開,其中一段螺旋為DNA識別螺旋.

同源異形結構域(Homeodomain,由同源異形盒編碼)中含有HTH基序。具有Homeodomain的轉錄調控蛋白胚胎髮育和正常細胞分化基因表達調節中有重要作用。

②鋅指(Zinc finger)基序

鏈的保守序列中的一對組氨酸加一對半胱氨酸(His2/Cys2)或2對半胱氨酸(cys2/cys2)與一個鋅離子形成配位鍵,這些胺基酸對之間的多膚鏈成環狀突出並摺疊成指形結構,多個指結構常串聯重複。

鋅指族轉錄因子二聚體形式同DNA上的順式調控元件結合。

含鋅指基序的轉錄因子:與GC盒結合的SPl、類固醇激素受體家族,抑癌蛋白WT1等。

亮氨酸拉鏈(Leucine-Zipper)基序

由一段每隔6個a a 就有一個Leu的伸展肽鏈組成,這些周期性出現的Leu都位於α-螺旋的同—側面,因此兩條均含Leu拉鏈基序的蛋白質通過亮氨酸側鏈的相互作用形成二聚體。

具有亮氨酸拉鏈基序的轉錄因子:原癌基因C-Jun/C-fos(APl家族)

④螺旋-環-螺旋(Helix-loop-Helix,HLHt)基序.

由2個α螺旋間隔一個非螺旋的環(loop)組成.

如原癌基因產物C-myc及其結合蛋白Max.

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