轉錄酶
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基因轉錄是以DNA為模板，在依賴於DNA的RNA聚合酶的催化作用下，將4種核苷酸合成RNA。原核生物的RNA聚合酶的結構很相似。在真桿菌中只有一種，負責mRNA、tRNA和rRNA的合成。大腸桿菌RNA聚合酶由多個亞基組成，全酶(holoenzyme)是α2β'βσ，相對分子質量約480 000。口亞基同全酶的結合不緊密，很容易解離下來。除去σ因子後剩下的部分稱為核心酶(α2ββ')。 利福黴素類藥物(rifamycins)和鏈霉溶菌素(sheptolydigin)通過與β亞基結合可抑制基因轉錄。σ因子即σ亞基的功能是使全酶識別啟動子並與之結合。大腸桿菌中只有一種RNA聚合酶，它要負責所有基因的轉錄，也就是要識別所有基因的啟動子。這項功能是由σ因子完成的。大腸桿菌至少有4種，因子：σ28、σ39、σ54和σ70，在不同環境下使用不同的σ因子。如環境溫度升高時，σ39使熱激基因表達；缺少氮時，σ54使可利用其他氮源的相關基因轉錄。枯草桿菌中有約10種，因子。σ因子的替換使用，調控不同基因的表達，控制著生命周期中出現的變化。例如，在正常生命周期中和在被噬菌體感染時，使用不同的σ因子，識別不同基因的啟動子。
作用機理
真核生物有三種RNA聚合酶（作用於非編碼區）：RNA聚合酶I、Ⅱ和Ⅲ，分別負責三類基因的轉錄。RNA聚合酶I定位在核仁，負責rRNA基因的轉錄。RNA聚合酶Ⅱ定位在核質，負責轉錄產生mRNA前體，即核不均一RNA——hnRNA(heterogeneousnuclear RNA)。RNA聚合酶Ⅲ定位在胞質，負責tRNA、5SRNA、Alu序列和其他小RNA的生成。
真核生物的RNA聚合酶的相對分子質量都比較大，在5x105以上，由8～14個亞基組成。葉綠體和粒線體的RNA聚合酶的活性較小，與細菌的RNA聚合酶更為相似，只負責轉錄為數不多的幾個特定的基因，沒有更複雜的功能。
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