丘腦被「Y」形纖維板——內髓板分為前核、內側核和外側核3部分。其中外側核又可分為背、腹兩層：
腹層由前向後分為腹前核、腹中間核(又稱腹外側核)和腹後核，
腹後核又分為腹後內側核和腹後外側核。
此外，在內髓板內有板核心，在第三腦室室周灰質內有正中核，在背側丘腦外面有丘腦網狀核。
前部 下丘腦前核 · 下丘腦室旁核 · 下丘腦視前區 · 下丘腦視上區 · 下丘腦視交叉上核
中間部/內側部/節部/垂體: 垂體漏斗 · 內側隆起 · 弓狀核 · 下丘腦腹內側核 · 下丘腦背內側核 · 灰結節、垂體腺 (垂體前葉、垂體後葉)
後部/側部 下丘腦後側核 · 乳頭體 · 下丘腦外側區
其它 內側前腦束
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